万历十二年的一天，灰蒙蒙的夜，有几分阴森森的宁静的长廊。远方一个红点晃动着，渐近了，原是一盏灯笼自深处急急跑来，似乎能听见提着灯笼的小太监急促的呼吸。
在这个凉爽的深秋，一脚脚踩着冰冷的青砖，“咯咯”的回响声渐远……
椒房宫院内，灯火通明，难产的郑妃在床上突然一松拳，没了声息。 接生婆取出擀面杖，狠狠顺着她肚子往下擀去，郑妃一声惨叫，贴身侍女素玉和众宫女们大惊失色。
豆房宫内，性情温和的宋妃正在为生产的郑妃祈福。剃着虎头的小男孩洛儿睡在床上，浑然不觉这一场关乎自己命运的浩劫。
郑妃娘娘终于诞下了一位小皇子，众人如释重负。
与此同时，煞是平凡的“硕二爷府”上，枣红马降子，二爷将足金的痒痒挠往腰上一插，忙不迭和大魁前去看看这早产的马驹。
皇宫南书房里，万历兴奋异常，命令大太监冯宝在紫禁城中齐燃焰花，庆贺小皇子的诞生。随着一阵巨响，角炮齐鸣。紫禁城夜空一片绚丽，五颜六色的焰花满天飞舞。
而在豆房宫院内，太监关于郑妃生下小皇子的急报使翠喜担心起立洛儿为太子的事，于是命太监急速禀报娘娘。
硕二爷马厩里，硕二爷从腰里取下金痒痒挠，给小马驹挠着痒痒儿。大魁好奇先皇所赐圣物为何这般用途，二爷不以为然。
突然一声巨响，小马驹吓得缩到母马身下。硕二爷抬头看天，隐约有彩色的光焰闪烁。他朝院门外走去，搭救了驴车下叫花子模样的小伙子，然而大魁对二爷的爱管闲事，颇为不满。
椒房宫里人影忙碌，万历抚弄着皇子的小脸，开怀朗笑。郑妃见状面有得意。
采菊斋内，硕二爷拿起画好的菊花，发现上面有泡鸟屎，他笑着从印盒里取出一枚闲印盖在屎旁，并高高兴兴将鸟屎拔去。
皇上的笑声充斥在椒房宫内。郑妃顺势要求万历允诺，立新生的皇子为储。万历一震，冯宝见状吞吞吐吐地替万历解围，郑妃怒气冲冲，寻死寻活。
从街上背回的小伙假寐中偷偷看着马厩里的一切，他自称傻三。
太后对郑妃新生下小皇子有几分欣喜，却不满其独受万历专宠，又欲借机立小皇子为储之事。万历惊慌中急急告退。太后看着他远去的方向，似有预感，心事重重。
万历对冯宝诉说立储之难，冯宝告知，郑妃哥哥——平王已等在南书房外要拜见皇上。而万历似乎早已知道他的来意。平王借“观音谱”向万历提议立小皇子为储，万历笑而不答，沉默不语。
收了好处的冯宝暗示平王，立储之事除太后外，闲居在大兴的硕二爷也不可小觑，因为听说先皇赐给他的圣物痒痒挠中，藏有关乎立储的密诏。平王一脸惊愕。
大魁怀疑跑得没影儿的傻三夹带了家里的东西，硕二爷不以为然，顺手写下嘲讽的贺喜对联。上联是，紫禁城喜得龙子普天同庆;下联是，硕王府福降马驹二爷高兴，横批，人畜两旺。硕二爷请诸位乡邻吃小红薯，众人齐声叫好，轰地涌进院去。大魁无奈。
文华殿内挂红披彩，喜气盈盈。万历兴致勃勃地在朝上接受百官的祝贺，并赐皇二子名为“常洵”。
素玉向郑妃禀告皇上赐名“常洵”之事，郑妃心中牵挂的却是立储。而此时，宋妃和大皇子前来探望郑妃，两宫女为郑妃梳妆，郑妃心烦意乱迁怒宫女，等在门外的宋妃皱眉听着。
平王启奏万历有仙鹊翩跹起舞，万历与众臣观看，脸露惊喜。平王顺势携诸大臣跪请皇上立下太子，顺乎天意。兵部左侍郎刘齐光和言官于直等人却在一旁不以为然。
椒房宫院屋里，郑妃仍慢条斯理梳妆打扮，素玉跑来禀告殿上情形，郑妃仰天大笑，吩咐把宋妃请进屋内。
文华殿内，万历欲立皇二子常洵为太子，刘齐光、于直欲上前劝诫，平王却挡在两位大臣身前。而此时，久病在家的首辅张不歪跌跌撞撞地上殿来，和于直一起强调“废长立幼，有悖旧制”之说。平王和九门提督葛坤联手与之争辩。万历见状扫兴退朝，拂袖而去。
椒房宫内，郑妃讥讽宋妃和皇长子常洛，双方不欢而散。宋妃牵着皇长子走出院门，突然听得宫内啪的一声脆响。原是郑妃得知了朝中之事，发了大怒。
宋妃担忧起自己与洛儿的命运，拉着洛儿加快脚步往外走去。
坤宁宫内，太后得张不歪授意，欲请硕二爷进宫。双方势力在紫禁城内外，剑拔弩张。
文华殿内，百官肃立，皇帝万历高坐，召见意大利教士克里蒂安和硫球国使臣广林。广林献上的夜明珠让万历欣喜不已。
硕二爷府门前，新任大兴县令冯青云和衙役们等在门口，欲收马驹税，大魁与之争论，硕二爷听得冯青云一身正气的回答，邀其入内。
硕二爷让大魁卖马垫税，大魁牵马欲走，却在马厩中发现了一把名贵的女用梳子。
皇上二大爷剧照
万历在南书房宴请国外使节，克里蒂安建议万历用西洋的方法公决立储之事，万历颇为所动。
硕二爷府门前，太监周顺奉太后指令一行骑马奔至，大魁以为又是前来讨税的，便谎称二爷不在府上。周顺却似早有准备就地一坐，大魁见情势不妙暗急，但还未来得及禀明二爷，周顺已闯进院内。硕二爷顺势拿周顺怀里的银子，付了冯青云的税。周顺欲请硕二爷进宫，二爷却把周顺拉入马厩，独自磨起驴牙。周顺傻眼，道出太后娘娘让硕二爷速带痒痒挠，进宫制止皇上废长立幼的实言。硕二爷却依旧装傻充愣。
皇上二大爷第2集剧情介绍郑妃在椒房宫内神情烦燥，担心二爷给太后抢了先，平王提出杀而后快，郑妃则要他赶到大兴去拜会二爷。
皇上询问视同己出的小扣子该派谁去大兴请二爷回京，小扣子提议克里蒂安。 万历大悦。
周顺和太监们骑马奔往齐家庄，突然三个蒙面人从树上跳下来将两个太监的马抢走。至河边，蒙面人掀开面罩，却是大江和他的两个随从。刘川骑马赶来，询问不知天高地厚的大江，大江却依然一幅贼寇像。
京南大红门酒楼的窗户外，跳进三条黑影与牛怀根较量起武功，经刘川介绍原是大江三人，并托牛怀根安顿三人，牛怀根满口答应。
广林以查问椿美公主下落为由想求见平王，贿赂之下，兵头道出平王去大兴找硕二爷的实情。
风尘仆仆的硕二爷和大魁牵着毛驴走在大兴街头，二爷欲带毛驴寻酒，毛驴却不听使唤，挣脱缰绳随母驴奔去。
胡同深处，硕二爷气喘喘，只见自家那头毛驴正与一短耳草驴耳鬓厮磨。另一头的大魁急急忙忙撞上了傻三。原来傻三的驴让巡街的衙役给吓跑了，于是缠着大魁给他找驴。小胡同里，硕二爷牵着自家的驴走来，那母驴也跟在身后走着。
傻三和大魁二人找驴不成，走在大兴街市上，却无意被被人流隔开着。傻三高声询问自己小梳子的下落，大魁却问他哪里偷的，傻三道是他亲娘给的，却又忽然神伤再也见不到亲娘了。突然，两匹马带着杀手山虎山豹奔来，众人惊呼躲闪着。大魁一把将傻三推开，傻三却不顾大魁，寻驴声而去，大魁搔着头皮，跟上。
硕二爷命小儿把毛驴儿牵到后院，好料好酒伺候。而店门外，杀手也到了。
在往大兴的道上，平王拼命催促，生怕二爷的人头落地。而慢悠悠走着的另一辆里，坐着的正是克里蒂安和助手比尔。
酒馆里，杀手两人盯着二爷的痒痒挠，相视一笑。二爷低着头只顾喝酒，却也觉出了一股莫名杀气。
大兴街市上大魁追傻三而来，煞是辛苦。
小酒馆里弥漫着紧张的气氛，杀手二人目光相视，脚踩暗号，正要拔剑，二爷也握紧了痒痒挠。突然傻三闯入，一声尖叫将二人怔住。同时一帮人却拥了上来，把傻三团团围住。山虎山豹见势悻悻坐下。
原来，傻三的驴脱缰乱跑，一群商人要他赔钱。二爷见大魁和傻三被推拥进了酒馆，而众人也认出了二爷。二爷发现自己捡的正是傻三的驴，众人却决意不放过傻三。二爷承诺替他赔钱，生意人才悻悻离开。坐在桌旁的山虎山豹冷眼看着，大魁发现，拉了拉硕二爷，二爷若无其事陪傻三去看驴。
刘川在京南大红门酒楼看戏听曲雅兴十足，以为一场杀二爷的好戏即将到来，而那边他的主子平王为了保住二爷的命此刻也来到了大兴。
后院里，硕二爷给驴喂酒，傻三乐得哈哈大笑，抚摸着自己的那头驴，决定把小梳子送给二爷。硕二爷询问傻三父母的情况，傻三眼神里晃过一丝伤感，抢过二爷的酒壶就往自己嘴里倒。
刘川得知平王要留二爷性命，脸色大变。平王让牛怀根阻止杀手行动，刘川唯恐为时已晚，于是平王驾着马车狂奔，刘川急追而去。只留下什么也不清楚的牛怀根傻愣在那儿。
大魁在店里发现了被绑的小二，二爷见状大惊和大魁急入厨间，见几个人被捆绑着，吱着乱叫。拔了嘴塞的小二喘着气，说不上话儿来，突然眼神直了，惊恐地看着暗处。暗处，山虎山豹提剑渐渐向二爷靠近，从背后用剑劈向二爷，二爷抬头猛地一吹，将柱上的灯“卟”地给吹灭了，屋里一团漆黑。刀剑风声骤起。小二和伙计会奔命而出，金属交锋的火花一闪一闪……
傻三发现里面一团漆黑，将两头毛驴拴在树上，嘴里叫着硕二爷、大魁哥，朝店里走去。黑暗中，伙计们奔出，一双黑手捂住了傻三。
山豹点亮了灯，与山虎一起持剑逼向二爷，大魁举着一叠碗碟连连飞掷过去，却都被山虎他们一一劈得粉碎。眼看一剑就要劈在硕二爷的头上，突然空中跳下一个人来，救了二爷一命，此人便是平王。傻三慌慌地从外面跑了进来，惊讶地看着面前的这一幕。
马蹄声中，山豹与山虎夺命而逃，却被一马拦住去路，山虎山豹举剑要杀，却见前面立马者是平王的管家刘川。
小酒馆内，二爷与平王针锋相对，平王欲笼络二爷送他进宫，二爷却不领情。平王冲二爷远去的背影啐了一口，然后一招手，与随从一起消失在另一个方向的茫茫夜色中。
树林子里，刘川要和山虎山豹解除杀二爷的契约，二人却以为刘川看不起他们，誓要取回二爷人头。
坤宁宫内，周顺正向太后禀报两天内的经过，万历却也前来，告知已差洋人克里蒂安去大兴请二爷。太后不悦。广林一路追来了大兴，平王态度冷漠，并将牛怀根教训了一顿，当得知傻三所运之物已经到达，才露出了些满意之色。平王嘱咐刘川切莫让大江和广林照上面，后得知杀手二人誓要取二爷人头，赶紧派人保护。
二爷与大魁回到家中，尾随而至的傻三却把他俩吓出一身冷汗。傻三执意要睡马厩，大魁抱着二爷掷给他的羊皮袄子追了出去。
而院外，刘川的人马朝硕二爷府抄来。
傻三见采菊斋的灯还亮着，遂从门缝里偷看，看见二爷摆弄着火盆，大魁已经睡着了。傻三悄悄离去。
刘川在院外搜索着西山刀客。
采菊斋里，火盆发出暗暗的红光。二爷一人独坐想着事，不能眠，于是给大魁掖了掖被子，又来到马厩，闭了窗，添了炭，给傻三掖了掖那件袄子。看着傻三眉清目秀，睡姿祥和，抱着那把梳子，二大爷若有所思。待硕二爷离去，傻三的眼角一颗泪淌下。
硕二爷府院门敞开，深秋里，若隐若现的狗吠显得这夜很宁静。
硕二爷坐在火盆旁边，靠在椅子上睡着了……
宁静的巷道，铁掌落在青石板上清脆的蹄声。逆光而行，两匹马并排踢踏而来，马上正是提着断魂剑的山虎、山豹他们……
